大多数合规类色谱软件采用数据库架构，主要原因在于数据存储在Windows资源管理器中，数据库存储更加满足严格的法规要求，以下是具体原因：

1.更好的保证数据完整性
操作全部完成或者回滚，避免数据中途损坏。
通过约束和事务机制保证数据逻辑正确。
多用户并发操作时防止数据冲突。
数据一旦提交即永久保存，即使系统故障也不丢失。
这些特性直接支持合规对数据可靠性和防篡改的要求。

2. 审计追踪
数据库可自动记录所有操作（如修改、删除）的详细信息（操作人、时间、内容），满足法规对全程可追溯性的要求。
对比文件系统，数据库的日志功能更结构化且不易被绕过。

3. 权限控制与安全性
支持细粒度权限管理（如仅允许特定角色修改参数），符合数据隐私和操作合规性。

4. 结构化数据管理
色谱数据包含样本信息、仪器参数、峰面积等复杂元数据，数据库通过表结构实现标准化存储，减少冗余和错误。
支持高效查询（如通过SQL快速检索历史实验数据），便于查询以便生成合规报告。

5. 数据备份与恢复
数据库内置的备份机制（如增量备份、日志）确保数据可恢复，避免因硬件故障导致数据丢失。
满足法规对数据长期归档（如15-30年）的要求。

6. 多用户并发
实验室环境中，多个用户可能同时访问同一实验数据，数据库的锁机制和事务隔离级别能有效管理并发操作，防止数据冲突。

7. 标准化
数据库支持ODBC/JDBC等接口，便于与其他实验室系统（LIMS、ELN）集成，形成合规数据链。
结构化数据格式（如通过API导出）简化了监管审查时的数据提交流程。

8. 应对法规明确要求
例如，FDA 21 CFR Part 11要求电子记录需具备审计追踪、权限控制和安全存储，数据库架构天然支持这些功能，而文件系统需额外开发且风险更高。

综上，数据库架构通过提供数据可靠性、安全性和可追溯性，成为合规类色谱软件的主流选择，直接满足监管机构对数据全生命周期的严格要求。

在这里也分享一下不同类型的数据所适合的数据库，在色谱信息管理系统中根据数据类型也会分为结构化数据（元数据，如：峰信息、系统设置、方法参数等），非结构化数据（原始数据，如：色谱图点位信息、压力监视点位信息等）。

根据不同的数据类型特点，也会适配有不同的数据库类型：
结构化数据：实验元数据（用户、仪器参数、审计日志）——适合关系型数据库（如Oracle/MySQL）。
非结构化数据：原始色谱/质谱文件（如.raw、.wiff）、多维实验配置——适合文档型/对象存储（如MongoDB、MinIO）。

数据库的权限控制比骄容易。如果基于windows 或其他操作系统的，会由于OS权限导致数据完整性的问题。比如删除、修改、路径、命名等问题

合规类软件普遍采用数据库架构的原因可归纳为以下几点：

1. 高效的数据管理
   数据库系统（如关系型数据库）提供了结构化存储，支持复杂查询和事务处理，确保数据的一致性和完整性，满足合规性对数据准确性的高要求。

2. 严格的安全与权限控制
   数据库内置的权限管理机制（如角色访问控制、加密存储）有效防止未授权访问和数据泄露，符合GDPR、HIPAA等法规对数据安全的要求。

3. 审计与追溯能力
   数据库的事务日志和版本控制功能可详细记录数据操作历史，便于生成审计报告和追踪数据变更，满足合规审计的透明性需求。

4. 灵活的报表生成
   通过SQL查询和数据分析工具，能够快速生成符合法规要求的定制化报告（如财务合规报告、数据隐私评估），提升效率并减少人为错误。

5. 系统集成与互操作性
   数据库作为标准化数据存储层，可通过API、ODBC/JDBC接口与企业现有系统（如ERP、CRM）无缝集成，简化数据交换流程。

6. 容灾与备份机制
   数据库的自动备份、主从复制及灾难恢复方案确保业务连续性，避免因数据丢失导致合规风险。

7. 适应法规变化的灵活性
   通过数据库模式迁移工具（如Flyway、Liquibase），能够快速调整表结构或添加新字段，以应对不断更新的法规要求。