一起共线分装的意思是同时吗？ 同时的话肯定是不行的，不管是什么产品，及时同产品不同批号也不应该在线同时分装，经过验证的混批除外。

如果是分批次前后共线生产的话，可以根据其性质进行共线评估。但是药品与非药品不能共线，商业化阶段。研发阶段，在可以明确风险的基础上，可能还有操作的空间。

法规层面，的确没有写过不可以。但是共线生产是个很具体的问题，没有了解详细场景的情况下，别人很难给答案。

例如，你说的如果只是在一个车间内，但是蛋白酶和单抗各自是不同的时段分装，即采取阶段生产的方式，那风险最小，做好清洁验证和其他管理基本没有挑战。

如果你选择在一个时段内在该功能间内同时进行分装，那问题就更复杂了。分装酶和抗体原液的方式是敞口还是密闭。如果是敞口方式各自所处的分装环境能否阻挡分子扩散混入另一边去？如果是密闭，那有没有用到共用管道，凡此种种都是具体情形才能判断的问题。

蛋白酶和抗体的相互的残留不只是在于蛋白酶对抗体可能的破坏，还可能还涉及到杂质。这个蛋白酶的生产很大可能应该是用大肠杆菌这类原核生物吧（猜测），而抗体是293这类真核生物生产的。在共线指南中就提到过： “在下游纯化阶段，在确保没有活的原核生物和活的真核生物的情况下，可以考虑经过充分的风险评估采取有效的控制交叉污染措施后多产品共线生产。”指南这里考虑的是活微生物的残留的影响。你没有提到能不能保证原液中不完全没有存活的细菌或细胞的措施。而且原核和真核两种生产系统有很大差异，各自得到的原液中的宿主蛋白和DNA的差异很大，很可能是超出下游的纯化能力范围的，且短时的简单的清洁用的溶液或方法也不适用于对方。指南这里强调的充分的评估和措施就很有挑战了。

所以，就你提供的信息，没法确定回答。自己判断是否能做到两者在分装时不会相互接触到，否则就得采取措施。